ProLego Protein as lego blocks ...
 
Protein Information
PDBId & Chain3DSS : A
MoleculeGeranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha
Residues313
Sequence
SSE Sequence*(15) HHHHHHHHHHHHHHH
Protein Topology 

Topology Information

Protein topology is represented by contact and orientation of secondary structure elements (SSEs). The figure on the left represents the contact map with information on type of orientation two SSEs share (color coded). The matrix can be represented in following string representation.

Contact String
cs [Click here to expand]
Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hr.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.0.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0

Prefence of topology : False

Linear Topology Graph : 3DSS_A
shapeImage
Protein Id: 3DSS_A
Topology Graph : 3DSS_A
shapeImage
Protein Id: 3DSS_A
Modules in queried Topology
#SSE SSE string Contact String Preferrence  ProteinDB  DomainsDB
3 HHH Ha.Ha-Hr False 3RQ9:B, 2C5R:A, 2DS2:B, 2IDO:B, d1ha8a_, d1rrza_, d1whua_, d2bnka_, d2idob_, 1ha8A00, 1rrzA00, 1whuA00,
3 HHH Ha.Ha-Hp True 2WY8:Q, 2XF7:A, 2XF7:B, 2XF7:C, 2XF7:D, 2XF7:E, 2XF7:F, 2XVT:A, 2XVT:B, 2XVT:C, 2XVT:D, 2XVT:E, 2XVT:F, 3A8Y:C, 3A8Y:D, 3BBZ:A, 3BBZ:B, 3EAB:A, 3EAB:B, 3EAB:C, 3EAB:D, 3EAB:E, 3EAB:F, 3GI7:A, 3GI7:B, 3GN4:A, 3L8R:A, 3L8R:B, 3L8R:C, 3L8R:D, 3L8R:E, 3L8R:F, 3L8R:G, 3L8R:H, 3LOF:A, 3LOF:B, 3LOF:C, 3LOF:D, 3LOF:E, 3LOF:F, 3MQ1:A, 3MQ1:B, 3MQ1:C, 3MQ1:D, 3MQ1:E, 3MQ1:F, 3MXZ:A, 3MZW:B, 3OVU:A, 3PH0:C, 3PH0:D, 3RGU:A, 3RGU:B, 3RGU:C, 3RGU:D, 3T47:A, 3UUL:A, 3UUL:B, 3UUN:A, 3UUN:B, 3ZE3:B, 3ZE3:C, 3ZE3:F, 4A5X:A, 4A5X:B, 4CC9:B, 4CQI:A, 4FM3:A, 4FM3:B, 4FM3:C, 4FM3:D, 4FZP:A, 4FZP:B, 4H10:A, 4HKZ:H, 4HWC:A, 4HWC:B, 4HWC:C, 4HWC:D, 4HWC:E, 4HWC:F, 4HWD:A, 4HWD:B, 4HWD:D, 4HWH:A, 4HWH:B, 4HWH:C, 4HWH:D, 4HWH:E, 4K12:B, 4KBQ:C, 4KBQ:D, 4MBQ:A, 4MBQ:B, 4MBQ:C, 4MBQ:D, 4MBQ:E, 4MBQ:F, 4NPD:A, 4NTW:C, 4PS2:A, 4TX5:A, 4TX5:B, 4U7I:A, 4U7Y:A, 4UI1:C, 4UI1:D, 4Z8L:E, 4ZNC:A, 4ZNC:B, 4ZNC:C, 5DJT:B, 5FVK:A, 5FVK:B, 5JSN:B, 5JSN:D, 5LB7:B, 1EZ3:A, 1LJ2:A, 1LP1:A, 1WRD:A, 1Z8U:A, 2C5K:T, 2E2A:A, 2ERL:A, 2FCW:A, 2FZT:A, 2GOM:A, 2J5Y:A, 2NOJ:B, 2V6Y:A, 2W2U:A, 3LF9:A, 3LG7:A, 3LHP:S, 3QWO:C, 3S1K:A, 4IOI:H, 4L8I:A, 4OYD:B, 5DJU:B, 5EFW:B, 5GNA:A, 5J0L:A, 5JSB:B, d1chua1, d1cuna2, d1ez3a_, d1fpoa2, d1g73a_, d1gpja1, d1gvna_, d1hcia4, d1hf8a1, d1iura_, d1lvfa_, d1m62a_, d1nrea_, d1nu9c1, d1o3xa_, d1o7d.1, d1qsda_, d1r4ga_, d1s35a1, d1s35a2, d1u5pa1, d1u5pa2, d1uura1, d1vcta1, d1wfda_, d1wrda1, d1x4oa1, d1x4pa1, d1x9ba_, d1xvha2, d1z8ua_, d2cpta1, d2crba1, d2e2aa_, d2erla_, d2fcwa1, d2fzta1, d2goma1, d2j5ya_, d2pmra1, d2qalt1, d2uubt1, d3bvua1, d3l8ra_, d3ldqb_, d3qwoc_, 1deeG00, 1deeG00, 1ez3A00, 1g73A00, 1gvnC00, 1hciA04, 1lj2A00, 1lp1B00, 1lreA00, 1lvfB00, 1m62A00, 1o3xA00, 1qsdA00, 1r73A00, 1t6oA00, 1wfdA00, 1x9bA00, 2e2aA00, 2erlA00, 2vqeT00,
3 HHH Ha.Ha-0 True 3RKO:A, 3RKO:E, 3RKO:G, 3RKO:K, 3SHG:B, 3THF:A, 3THF:B, 3U0C:A, 3U0C:B, 3ZE3:E, 4ADZ:A, 4ADZ:B, 4RP3:A, 4RP3:B, 4XA3:A, 5EU0:B, 5FMN:A, 5FMN:B, 5LCY:A, 5LCY:B, 5LCY:C, 5LCY:D, 5LSI:D, 5SZH:A, 5SZJ:B, 1UPT:B, 2HH7:A, 2P64:A, d1t50a_, d1uptb_, d2vv5a3, 1t50A00, 1uptF00,
4 HHHH Ha.Ha.Ha-Hp.Hp-0 True 3N1E:B, 3PCV:A, 3PLT:A, 3PLT:B, 3PLT:C, 4EXT:A, 4IP8:A, 4IP8:B, 4IP8:C, 4IP8:D, 4NTF:A, d1eo0a_, d2b5dx1, d2uuia1, 1eo0A00,
4 HHHH Ha.Ha.Ha-0.Hp-0 True 1HXI:A, 4JW2:A, d1hxia_, d1k1xa1, 1hxiA00,
5 HHHHH Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.Hp.Hp-0.0-0 True 5B1A:E, 5B1A:R, d1oxja2, d2v5fa_, d3ag3e_, 1v54E00,
5 HHHHH Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.0.Hp-0.0-0 True 3BEE:A, 3BEE:B, 3EDU:A, 3MA5:A, 3MA5:B, 3MA5:C, 3PDY:A, 3PDY:B, 1CUN:A, 1NA3:A, 1S35:A, 1U5P:A, 2VKJ:A,
6 HHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.Hp.Hp.0-0.0.0-0.0-0 False 4YVO:A, 4YVQ:C, 5IZW:A,
7 HHHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.Hp.Hp.0.Hp-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 False 5IWB:B, 2FBN:A, d2fbna1,
7 HHHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.0.Hp.Hp.Hp-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 True 2XEV:A, 2XEV:B, 4GCN:A, 4GCN:B, 5L0Y:A, 5L0Y:C, 5L0Y:F, 5L0Y:G, 5L0Y:H,
8 HHHHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 False 1KLX:A, 5CWF:A, 5CWH:A, 5CWI:A, 5CWJ:A, 5CWK:A, 5CWM:A, 5CWN:A, d1klxa_, 1klxA00,
8 HHHHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.0.Hp.Hp.Hp.Hp-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 False 3RO3:A,
9 HHHHHHHHH Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha.Ha-Hp.Hp.Hp.0.Hp.Hp.Hp-0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 False
Protein In ProLegoDB with identical/similar Topology