ProLego Protein as lego blocks ...
 
Protein Information
PDBId & Chain1S70 : B
MoleculeProtein phosphatase 1 regulatory subunit 12A
Residues291
Sequence
SSE Sequence*(16) HHHHHHHHHHHHHHHH
Protein Topology 

Topology Information

Protein topology is represented by contact and orientation of secondary structure elements (SSEs). The figure on the left represents the contact map with information on type of orientation two SSEs share (color coded). The matrix can be represented in following string representation.

Contact String
cs [Click here to expand]
0.0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.Ha.Ha.0.Ha.Hp-0.0.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.0.0.Hp.Hp.Hp.0-0.0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0

Prefence of topology : False

Linear Topology Graph : 1S70_B
shapeImage
Protein Id: 1S70_B
Topology Graph : 1S70_B
shapeImage
Protein Id: 1S70_B
Modules in queried Topology
#SSE SSE string Contact String Preferrence  ProteinDB  DomainsDB
3 HHH 0.Ha-0 True 3FXD:B, 3HLS:A, 3HLS:B, 3MTU:A, 3MTU:B, 3MTU:C, 3MTU:D, 3PH0:A, 3S6P:G, 4HP3:C, 4LN0:C, 4M70:R, 4UG3:C, 1LWU:A, 1M93:A, 2DB7:A, 2NR5:A, 2P58:A, d1iiea_, d2db7a1, d2nr5a1, 1iieA00,
3 HHH Ha.0-Hp False 4YVQ:A, 5B1A:H, 5B1A:U, 5WGB:B, d3ag3h_, 1se7A00, 1v54H00,
3 HHH 0.Ha-Hp False 3RET:A, 3RET:B, 3RMI:A, 4RNG:D, 5VHT:A, 5VHT:B, 1ECM:A, 2WT7:B, d1ecma_, d1ybza1, d3reta_, 1ecmA00,
3 HHH Ha.0-0 False 3BPJ:A, 3BPJ:B, 3BPJ:C, 3BPJ:D, 3MTU:E, 3MTU:F, 4CLQ:B, 4HFX:A, 4IAO:C, 4IAO:D, 4OM3:A, 4X86:A, 4YTW:A, 4YTW:C, 5FD9:A, 1YKH:B, 2B9C:A, d1ykhb1, d2bskb1,
3 HHH Ha.Ha-Hp True 2WY8:Q, 2XF7:A, 2XF7:B, 2XF7:C, 2XF7:D, 2XF7:E, 2XF7:F, 2XVT:A, 2XVT:B, 2XVT:C, 2XVT:D, 2XVT:E, 2XVT:F, 3A8Y:C, 3A8Y:D, 3BBZ:A, 3BBZ:B, 3EAB:A, 3EAB:B, 3EAB:C, 3EAB:D, 3EAB:E, 3EAB:F, 3GI7:A, 3GI7:B, 3GN4:A, 3L8R:A, 3L8R:B, 3L8R:C, 3L8R:D, 3L8R:E, 3L8R:F, 3L8R:G, 3L8R:H, 3LOF:A, 3LOF:B, 3LOF:C, 3LOF:D, 3LOF:E, 3LOF:F, 3MQ1:A, 3MQ1:B, 3MQ1:C, 3MQ1:D, 3MQ1:E, 3MQ1:F, 3MXZ:A, 3MZW:B, 3OVU:A, 3PH0:C, 3PH0:D, 3RGU:A, 3RGU:B, 3RGU:C, 3RGU:D, 3T47:A, 3UUL:A, 3UUL:B, 3UUN:A, 3UUN:B, 3ZE3:B, 3ZE3:C, 3ZE3:F, 4A5X:A, 4A5X:B, 4CC9:B, 4CQI:A, 4FM3:A, 4FM3:B, 4FM3:C, 4FM3:D, 4FZP:A, 4FZP:B, 4H10:A, 4HKZ:H, 4HWC:A, 4HWC:B, 4HWC:C, 4HWC:D, 4HWC:E, 4HWC:F, 4HWD:A, 4HWD:B, 4HWD:D, 4HWH:A, 4HWH:B, 4HWH:C, 4HWH:D, 4HWH:E, 4K12:B, 4KBQ:C, 4KBQ:D, 4MBQ:A, 4MBQ:B, 4MBQ:C, 4MBQ:D, 4MBQ:E, 4MBQ:F, 4NPD:A, 4NTW:C, 4PS2:A, 4TX5:A, 4TX5:B, 4U7I:A, 4U7Y:A, 4UI1:C, 4UI1:D, 4Z8L:E, 4ZNC:A, 4ZNC:B, 4ZNC:C, 5DJT:B, 5FVK:A, 5FVK:B, 5JSN:B, 5JSN:D, 5LB7:B, 1EZ3:A, 1LJ2:A, 1LP1:A, 1WRD:A, 1Z8U:A, 2C5K:T, 2E2A:A, 2ERL:A, 2FCW:A, 2FZT:A, 2GOM:A, 2J5Y:A, 2NOJ:B, 2V6Y:A, 2W2U:A, 3LF9:A, 3LG7:A, 3LHP:S, 3QWO:C, 3S1K:A, 4IOI:H, 4L8I:A, 4OYD:B, 5DJU:B, 5EFW:B, 5GNA:A, 5J0L:A, 5JSB:B, d1chua1, d1cuna2, d1ez3a_, d1fpoa2, d1g73a_, d1gpja1, d1gvna_, d1hcia4, d1hf8a1, d1iura_, d1lvfa_, d1m62a_, d1nrea_, d1nu9c1, d1o3xa_, d1o7d.1, d1qsda_, d1r4ga_, d1s35a1, d1s35a2, d1u5pa1, d1u5pa2, d1uura1, d1vcta1, d1wfda_, d1wrda1, d1x4oa1, d1x4pa1, d1x9ba_, d1xvha2, d1z8ua_, d2cpta1, d2crba1, d2e2aa_, d2erla_, d2fcwa1, d2fzta1, d2goma1, d2j5ya_, d2pmra1, d2qalt1, d2uubt1, d3bvua1, d3l8ra_, d3ldqb_, d3qwoc_, 1deeG00, 1deeG00, 1ez3A00, 1g73A00, 1gvnC00, 1hciA04, 1lj2A00, 1lp1B00, 1lreA00, 1lvfB00, 1m62A00, 1o3xA00, 1qsdA00, 1r73A00, 1t6oA00, 1wfdA00, 1x9bA00, 2e2aA00, 2erlA00, 2vqeT00,
3 HHH Ha.Hp-0 False 3AAI:B, 3AAI:D, 1XOU:B, d1ud0a_, d1xoub_,
4 HHHH 0.0.Ha-0.0-0 False 4H9D:C, 5JVP:D, 2OTA:A, d2otaa1,
4 HHHH Ha.0.Ha-Hp.Hp-Ha True 4M70:A, 4M70:H, 4M70:I, 4M70:L, 4M70:Q,
4 HHHH Ha.0.Ha-0.0-0 True 5GYR:A, 5GYR:E, 5GYR:J, 5GYR:N, 5LBM:A,
4 HHHH 0.Ha.Ha-0.Hp-0 True 3LBX:A, 3TUL:B, 3TUL:C, 4MYY:A, 4RKU:L, 1A32:A, 1K04:A, d1a32a_, d1k04a_, 1a32A00, 1a32A00,
4 HHHH Ha.0.Ha-Hp.Hp-0 False 3HPH:F,
6 HHHHHH Ha.0.Ha.0.Ha-Hp.Hp.Hp.Hp-Ha.0.Ha-0.0-0 False 2XEN:A, 2ZGD:A,
7 HHHHHHH Ha.0.Ha.0.Ha.0-Hp.Hp.Hp.Hp.Hp-Ha.0.Ha.0-0.0.0-0.0-0 False
8 HHHHHHHH Ha.0.Ha.0.Ha.0.Ha-Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp-Ha.0.Ha.0.Ha-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 True 4HRN:A, 4HRN:B, 5EID:A, 2JAB:A, 2V5Q:C, 5O2T:B, d1dcqa1,
15 HHHHHHHHHHHHHHH 0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.Ha.Ha.0.Ha.Hp-0.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.Hp.0.0.Hp.Hp.Hp.0-0.Ha.0.Ha.0.Ha.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0.0-0.0.0.0.0-0.0.0.0-0.0.0-0.0-0 False d1s70b_,
Protein In ProLegoDB with identical/similar Topology